При осуществлении хозяйственных операций иногда возникает необходимость корректировки налоговой накладной. Также это актуально, когда налоговым органом осуществлена остановка регистрации налоговой накладной. Однако очень часто Налоговые органы часто не хотят вникать в проблемы налогоплательщика, и толкует это так, что налогоплательщик предоставил две разные налоговые накладные, а последнюю — еще с нарушением сроков регистрации налоговой накладной, предусмотренной ст. 201 Налогового Кодекса.
Как предусмотрено п. 198.6 ст. 198 Налогового Кодекса, на время остановки регистрации налоговой накладной/корректировки в Едином реестре налоговых накладных согласно ст. 201 Налогового кодекса течение такого срока прерывается на период остановки их регистрации и возобновляется со дня прекращения процедуры остановки регистрации налоговой накладной.
П. 121.-1.1 ст. 121-1 Налогового Кодекса указано, что в случае остановки регистрации налоговой накладной/корректировки в Реестре налоговых накладных согласно ст. 201 Налогового Кодекса, штрафы не налагаются на время приостановления регистрации налоговой накладной до принятия решения о восстановлении регистрации налоговых накладных, корректировки согласно ст. 201 Налогового Кодекса.
Учитывая вышеизложенное, применение штрафа Налоговым органом на время остановки регистрации налоговой накладной и восстановление со дня процедуры остановки незаконно.
Такой вывод был сделан Апелляционным Административным судом 31 июля 2017 по делу по иску ООО в Налоговый орган о признании противоправным и отмене налогового уведомления-решения.
В дальнейшем решение Апелляционного Суда постановлением Верховного Суда от 25 января 2024 года оставлено без изменений.